制药厂房的空气净化车间系统提供的空气质量将直接影响在该环境中生产药品的微粒和微生物污染的水平，进而直接影响药品生产的质量。空气净化系统是一个动态系统，需要关注系统的运行状态。空气净化系统有两种观念:一是正压控制，防止外界空气对环境的影响;二是负压控制，防止生产过程中产生的微粒污染扩散。空调设计、安装和运行应满足不同的目的，所以系统需要严格测试、控制和验证。 制药工厂空气净化系统的主要用途是防止产品和洁净区受到微生物污染，防止用于制药生产的病毒、致病菌和芽孢菌的扩散和污染，防止诸如青霉素或其他高活性药品的扩散和污染，防止固体粉尘的扩散污染。因此，净化空调的等级，在空气净化车间系统的验证中要重点考虑如下几点:首先，空气的流向必须是从关键区或更清洁的区域到环绕区域或低级别的区域;其次，为保证区域空气的洁净度和空气流向，集中式净化空调，空气的进风和排风必须平衡，保证空气的换气次数、气流模型、压差;再其次，操作区域的每个房间应对以下指标进行控制:送风的位置和数量、排风的位置和数量、换气次数、排风比例、产品裸露区域的气流模型、产品裸露点的空气速度等;最后，洁净度测定应包括悬浮粒子和微生物的测定。医药行业对于空气净化系统的要求相当严格，包括进风、空气处理、送风、排风等环节，因此，空气净化系统必须周期性检测其质量特性。
室内的风机盘管工作时，吸入一部分由风柜处理的新风，再吸入一部分室内未处理的空气经工艺处理后，由风口送出，能够吸收室内余热。余温的空气，使室内温度、湿度达到所需求的标准，如此循环工作。
风机盘管空调系统是风机和管理（小型表面式换热器）组成的机组直接安装在空调房间内，净化空调维护保养，风机将室内一部分空气进行循环处理（经空气过滤器过滤和盘管进行冷却或 加热）后直接送入房间，已达到对室内空气进行温、湿度调节的目的。
房间所需的新鲜空气可以通过门窗的渗透或直接通过房间，所设新风口进入房间，或将室外空气经过新风机组集中处理后，净化空调，由管道直接送入被调房间或者由风机盘管的空气入口处与室内进行混合后再经风机盘管进行热湿处理后送入室内。
盘管处理空气的冷媒和热媒由集中设置的冷源和热源提供。因此，风机盘管系统冷量是分别由空气和水带入空调房间内，所以此空调系统又被称为空气水系统。
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